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Text File  |  1995-07-26  |  2KB  |  38 lines
  1. **********************************************************************
  2. * Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme family signatures *
  3. **********************************************************************
  4.  
  5. Mandelate racemase   (EC 5.1.2.2)   (MR)  and   muconate  lactonizing   enzyme
  6. (EC 5.5.1.1)  (MLE)  are  two  bacterial  enzymes  involved  in  aromatic acid
  7. catabolism. They  catalyze  mechanistically  distinct  reactions  yet they are
  8. related at  the  level of their primary, quaternary (homooctamer) and tertiary
  9. structures [1].
  10.  
  11. A number  of  other proteins also seem to be evolutionary related to these two
  12. enzymes. These are:
  13.  
  14.  - The various plasmid-encoded chloromuconate cycloisomerases (EC 5.5.1.7).
  15.  - Escherichia coli hypothetical protein yidU [2].
  16.  - A hypothetical protein from Streptomyces ambofaciens [3].
  17.  
  18. We developed two signature patterns for these enzymes;  both contain conserved
  19. acidic residues.
  20.  
  21. -Consensus pattern: A-x-[SAG](2)-[LIVM]-[DE]-x-A-x(2)-D-x(2)-[GA]-[KR]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24.  
  25. -Consensus pattern: G-x(7)-D-x(9)-A-x(14)-[LIVM]-E-[DENQ]-P-x(4)-[DENQ]
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: bovine  myristoylated  alanine-rich
  28.  C-kinase substrate.
  29.  
  30. -Last update: October 1993 / First entry.
  31.  
  32. [ 1] Neidhart D.J., Kenyon G.L., Gerlt J.A., Petsko G.A.
  33.      Nature 347:692-694(1990).
  34. [ 2] Burland V.D., Plunkett G. III, Daniels D.L., Blattner F.R.
  35.      Genomics 16:551-561(1993).
  36. [ 3] Schneider D., Aigle B., Leblond P., Simonet J.M., Decaris B.
  37.      EMBL/GenBank: X70975.
  38.